技能属性的合理分配是战斗策略的核心。游戏中的技能分为物理攻击、特殊攻击、变化技能三大类，每种技能都有其独特的属性和效果。物理攻击技能如劈瓦和地震主要依赖攻击力属性，而特殊攻击技能如精神冲击和喷射火焰则取决于特攻属性。变化技能不造成直接伤害，但能改变战斗状态，如催眠术和剑舞。理解这些基础分类是技能分配的前提。
技能分配的首要原则是根据口袋妖怪的种族值和个体值进行针对性强化。高攻击种族值的口袋妖怪如快龙和班吉拉，应优先分配物理攻击技能；高特攻种族值的口袋妖怪如胡地和太阳精灵，则更适合特殊攻击技能。同时要考虑技能威力与命中率的平衡，高威力技能往往伴随较低命中率，如暴风雪和打雷，这类技能需要谨慎选择。属性克制关系也至关重要，尽量确保队伍能覆盖多种属性攻击。
努力值的分配直接影响技能效果的最大化。击败不同种类的野生口袋妖怪可获得特定属性的努力值，这些数值会永久提升对应能力。若想强化物理攻击技能，可通过击败提供攻击努力值的口袋妖怪来训练；同理，特殊攻击技能则需要特攻努力值。单一属性的努力值上限为252点，合理分配510点总努力值是提升战斗力的关键。速度努力值往往被忽视，但它决定了出手顺序，在某些情况下比攻击属性更重要。
技能搭配需要考虑战斗的持续性和应变能力。理想的技能组合应包含本系技能、补盲技能和变化技能。本系技能能获得属性一致加成，是主要输出手段；补盲技能用于应对抵抗本系的对手；变化技能则提供战术灵活性。四个技能槽的分配建议采用两攻一辅一保的模式，即两个攻击技能、一个辅助技能和一个保命技能。辅助技能如剑舞可以强化自身，而睡觉等恢复技能能延长战斗续航。
一个平衡的队伍应该能应对各种属性挑战，避免出现明显的属性盲点。火系、水系、电系和格斗系技能是较为通用的选择，能覆盖大多数常见属性。同时要注意防范常见威胁，如准备应对龙系和飞行系的口袋妖怪。技能分配不是一成不变的，应根据实际战斗情况不断调整优化，这也是游戏深度和乐趣所在。
